位于东京西部的(🛺)巨大“学园(🚗)都市”。在(🏷)总人口达230万人，其中约(🤖)8成(🦐)是(🏖)学(🖊)生的(🖐)这座都市中，实施着超能力开(⚾)发的特殊课程，学生(🛴)们的能力被给予从(🍹)“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的(😋)六阶段评价。 　(👁)　高中生上条当麻，也是住在学园(✅)都(🚄)市的学生之一(💺)。他由于隐藏在右手中的力量—(🔔)—只要是异能之力，就连神的加(⬅)护都(😜)能(💌)消(👮)除(🎸)的“幻(⬆)想杀手Imagine Breaker”，而被评(🔽)价为名落孙(🐠)山的“无(🐸)能力”，过着充满不幸的人生。 　　而上条的学生生(⏲)活，由于暑假开(🌟)始时从天而降的纯白修女而发生(🧕)了巨大的变化。自(🔼)从与逃离“魔法”世(🍲)界的她(🏕)——“禁书目录茵蒂克丝(💅)”相遇开始，上条就被卷入了各种各样(🏭)的事件中。统率学园都市的“科(🏰)学”方、与茵蒂克丝关(🍴)联的(📉)“魔法”方，在(🌮)惊(🍕)险(🌩)地解决双方(🏰)事(💞)件的过程中，他的人际(📳)关系也(🚅)逐步扩展。之后，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教，终于注意(💓)到上(🤸)条的存在…(🆖)…。 　　(👤)如同呼应魔(🛣)法方一般，科学方的学园都(🌙)市也(🥥)有所动作(🥢)。但也有与逐渐开始对(🏍)立的世(🕓)界动向抗争的人不(🖕)断(🤺)出现。那些通过与上(🥏)条有所关联，而使命运大为(🚛)改变的“英雄”们。 　　他(🏝)们挺身(🎎)而出与世界对峙。如同上(🐖)条(🍴)当麻做过的那样。 　　科学与魔法第三次交(🆒)织之(🆖)时，故事将大幅推进！！