位于东京西部(💡)的巨大“学园都(🕎)市”。在总人口达230万(👛)人，其中约8成(⛔)是学生的这座(⏪)都市中，实施(💃)着(〽)超(📻)能力(🆖)开发的特殊课程，学生们的能力被给(❄)予从“无(😨)能力Level 0”到“超(🦊)能力(🌍)Level 5”的六阶(🆕)段评价。 　　高中生上条当麻，也(🦊)是(📞)住在学园都(🎛)市的学生之一。他由于隐藏(🔁)在右手中(🎖)的力(🗽)量——只要是异能之力(💅)，就(🔚)连神的(👸)加护都能消除的“幻想(♌)杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的“无(🎮)能力”，过着充满不幸的人生。 　(🔜)　而上条的学生生活(💥)，由于暑假开始时从(🏯)天而降的纯白修女而发生了(🛄)巨大的(🌼)变(🎯)化。自从与逃离“魔法”世界的(🏥)她——“禁书目录茵蒂克丝(😘)”相遇(💙)开始，上条就(🆓)被卷入(🏯)了各种各样的事件中。统率学园都(🖱)市的“科学”方(🚋)、与茵(🍋)蒂克丝(🗼)关联的“魔法(🧒)”方(🈯)，在惊险地解决双方事件的(🅾)过程中，他的人际关系也逐步扩展。之后(🌂)，魔法一方的十(🤤)字教最大宗派罗马(🖖)正教，终于注意(✈)到上条(😆)的(☕)存在……。 　　如同(👃)呼应魔法方一般，科学方的学园(🚚)都市也(🥌)有(⏪)所动作。但也(🔟)有与逐渐开始对立的世界(💥)动向抗(🔮)争(🚷)的(🌸)人不断出现。那(🏁)些通过与上条有所关联，而使命运大为改变的“英雄”们。 　　他(💷)们挺身而出与世界对峙。如同上条当麻做过的那样。 　　科学与魔法(🔈)第三次交(🗽)织之时，故(😀)事将大幅推进！！